再后来，这个词少了种族或政治方面的含意，多了宗教方面的含意，变成指一种盛行于古代示剑和撒马利亚一带的宗教，信这种宗教的人信守一些与犹太教截然不同的规条。（约4:9）

撒马利亚人可能在公元前4世纪，在基利心山上建造神殿，好跟耶路撒冷的圣殿一比高下。有些学者认为，这件事标志着撒马利亚人跟犹太人彻底决裂了，但有些学者认为，在这件事过了一百多年后，两个民族才最终决裂。当耶稣在地上传道时，基利心山的神殿已经被摧毁了大约一百五十年。虽然如此，两个民族仍然彼此仇视。（约4:9）