Herudover skrev Paulus imidlertid et brev til Filemon hvori han personligt fremsatte en indtrængende bøn til gavn for Onesimus. Det var et brev der var skrevet med hans egen hånd — noget der var usædvanligt for Paulus. (Filem. 19) Dette gav brevet et personligt præg som i høj grad bidrog til at give hans anmodning vægt.

Han beder om at Onesimus må blive venligt modtaget, på samme måde som Paulus selv ville være blevet modtaget. Paulus beder om at det må blive sat på hans regning hvis Onesimus har gjort Filemon uret, for som han skriver til Filemon: ’Du skylder mig endog dig selv.’ (V. 16, 19)